*: Bump PORTREVISIONs for math/mpc update to 1.3.1
This commit is contained in:
Gerald Pfeifer
parent
dfcb95c892
commit
8d3e020ed0
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@ -1,5 +1,6 @@
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PORTNAME= zip
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DISTVERSION= 2.3.0
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PORTREVISION= 1
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CATEGORIES= archivers
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DISTNAME= ${PORTNAME}_${DISTVERSION}
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@ -1,5 +1,6 @@
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PORTNAME= blosc2
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PORTVERSION= 2.2.0
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PORTREVISION= 1
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CATEGORIES= archivers python
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MASTER_SITES= PYPI
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PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
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@ -1,6 +1,6 @@
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PORTNAME= vbz-compression
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DISTVERSION= 1.0.2
|
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PORTREVISION= 1
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PORTREVISION= 2
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CATEGORIES= archivers
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MAINTAINER= jwb@FreeBSD.org
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@ -1,5 +1,6 @@
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PORTNAME= maptools
|
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DISTVERSION= 1.1-4
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PORTREVISION= 1
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CATEGORIES= astro
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DISTNAME= ${PORTNAME}_${DISTVERSION}
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@ -1,5 +1,6 @@
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|||
PORTNAME= astrometry
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PORTVERSION= 0.93
|
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PORTREVISION= 1
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||||
CATEGORIES= astro
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MASTER_SITES= http://astrometry.net/downloads/
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DISTNAME= ${PORTNAME}.net-${PORTVERSION}
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@ -1,5 +1,6 @@
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PORTNAME= ${GH_PROJECT:tl}
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PORTVERSION= 0.3.0
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PORTREVISION= 1
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DISTVERSIONPREFIX= v
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CATEGORIES= astro
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@ -1,6 +1,6 @@
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PORTNAME= gnuastro
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PORTVERSION= 0.19
|
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PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= astro
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MASTER_SITES= GNU
|
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@ -1,5 +1,6 @@
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PORTNAME= kosmorro
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PORTVERSION= 0.10.11
|
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PORTREVISION= 1
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||||
CATEGORIES= astro python
|
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MASTER_SITES= PYPI
|
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@ -1,5 +1,6 @@
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|||
PORTNAME= kstars
|
||||
DISTVERSION= 3.6.4
|
||||
PORTREVISION= 1
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||||
PORTEPOCH= 1
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||||
CATEGORIES= astro kde
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MASTER_SITES= KDE/stable/${PORTNAME}
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@ -1,6 +1,7 @@
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|||
PORTNAME= libosmium
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 2.19.0
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= astro geography devel
|
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||||
MAINTAINER= amdmi3@FreeBSD.org
|
||||
|
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@ -1,6 +1,6 @@
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|||
PORTNAME= merkaartor
|
||||
PORTVERSION= 0.19.0
|
||||
PORTREVISION= 10
|
||||
PORTREVISION= 11
|
||||
CATEGORIES= astro
|
||||
|
||||
MAINTAINER= dev2@heesakkers.info
|
||||
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@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= nightfall
|
||||
PORTVERSION= 1.92
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
CATEGORIES= astro education
|
||||
MASTER_SITES= http://www.la-samhna.de/nightfall/
|
||||
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||||
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|||
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|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= OSKAR
|
||||
DISTVERSION= 2.8.3
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
CATEGORIES= astro
|
||||
|
||||
MAINTAINER= yuri@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
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|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= phd2
|
||||
DISTVERSIONPREFIX=v
|
||||
DISTVERSION= 2.6.10
|
||||
PORTREVISION= 6
|
||||
PORTREVISION= 7
|
||||
CATEGORIES= astro
|
||||
|
||||
MAINTAINER= acm@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
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|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= astlib
|
||||
PORTVERSION= 0.11.8
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= astro python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
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|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= astroML
|
||||
PORTVERSION= 1.0.2
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= astro
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= astropy-helpers
|
||||
DISTVERSION= 4.0.1
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= astro
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= astropy
|
||||
DISTVERSION= 5.2.2
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTEPOCH= 2
|
||||
CATEGORIES= astro
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= jplephem
|
||||
PORTVERSION= 2.18
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= astro python
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
||||
|
|
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|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= kosmorrolib
|
||||
PORTVERSION= 1.0.7
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= astro python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= metpy
|
||||
PORTVERSION= 1.4.1
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= astro python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= pyerfa
|
||||
DISTVERSION= 2.0.0.3
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= astro python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= pykep
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 2.6.2
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= astro python
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= pysofa
|
||||
DISTVERSION= 0.1.1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
CATEGORIES= astro devel python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= ro
|
||||
PORTVERSION= 3.6.9
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
PORTREVISION= 5
|
||||
CATEGORIES= astro python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= skyfield-data
|
||||
PORTVERSION= 4.0.0
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= astro python
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= skyfield
|
||||
PORTVERSION= 1.46
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= astro python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= spktype01
|
||||
PORTVERSION= 1.0.0
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= astro python
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= spktype21
|
||||
PORTVERSION= 0.1.0
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= astro python
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= qmapshack
|
||||
PORTVERSION= 1.16.1
|
||||
PORTREVISION= 5
|
||||
PORTREVISION= 6
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= V_
|
||||
CATEGORIES= astro
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= siril
|
||||
DISTVERSION= 1.0.6
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
CATEGORIES= astro graphics
|
||||
MASTER_SITES= https://free-astro.org/download/
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= stellarsolver
|
||||
DISTVERSION= 2.4
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= astro
|
||||
|
||||
MAINTAINER= acm@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= wcslib
|
||||
PORTVERSION= 7.12
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= astro
|
||||
MASTER_SITES= ftp://ftp.atnf.csiro.au/pub/software/wcslib/
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -2,7 +2,7 @@ PORTNAME= cheesecutter
|
|||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 2.9-beta-3-25
|
||||
DISTVERSIONSUFFIX= -gdbe9a9d
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
PORTREVISION= 5
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
|
||||
MAINTAINER= ehaupt@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= csound
|
||||
DISTVERSION= 6.15.0
|
||||
PORTREVISION= 6
|
||||
PORTREVISION= 7
|
||||
CATEGORIES= audio lang
|
||||
|
||||
MAINTAINER= yuri@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= emms
|
||||
DISTVERSION= 5.0
|
||||
PORTREVISION= 10
|
||||
PORTREVISION= 12
|
||||
CATEGORIES= audio elisp
|
||||
MASTER_SITES= GNU
|
||||
PKGNAMESUFFIX= ${EMACS_PKGNAMESUFFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= essentia
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 2.1_beta5-859
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
DISTVERSIONSUFFIX= -gb247091f
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= funktrackergold
|
||||
DISTVERSION= 1.5-2
|
||||
PORTREVISION= 8
|
||||
PORTREVISION= 9
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
MASTER_SITES= SUNSITE/apps/sound/players
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= gramofile
|
||||
PORTVERSION= 1.6P
|
||||
PORTREVISION= 14
|
||||
PORTREVISION= 15
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
MASTER_SITES= http://www.opensourcepartners.nl/~costar/gramofile/
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= gsequencer
|
||||
DISTVERSION= 4.4.3
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
MASTER_SITES= SAVANNAH/gsequencer/${DISTVERSION:R}.x
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= guitarix
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= V
|
||||
DISTVERSION= 0.44.1
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
PORTREVISION= 5
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
|
||||
PATCH_SITES= https://github.com/${GH_ACCOUNT}/${GH_PROJECT}/commit/
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= openspc
|
||||
PORTVERSION= 0.3.1
|
||||
PORTREVISION= 9
|
||||
PORTREVISION= 10
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
MASTER_SITES= http://membres.lycos.fr/pixels/ \
|
||||
LOCAL/ehaupt
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= pamixer
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 1.4-15
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
DISTVERSIONSUFFIX= -g4ea2594
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= pulseeffects
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 4.6.8
|
||||
PORTREVISION= 10
|
||||
PORTREVISION= 11
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
|
||||
MAINTAINER= daniel@shafer.cc
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= SoundFile
|
||||
DISTVERSION= 0.12.1
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= audio python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,4 +1,4 @@
|
|||
PORTREVISION= 0
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= audio python
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= essentia
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 2.1_beta5-859
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
DISTVERSIONSUFFIX= -gb247091f
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= librosa
|
||||
DISTVERSION= 0.10.0
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= audio python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= music21
|
||||
DISTVERSION= 7.3.3
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= audio python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= pydub
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 0.25.1
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
#MASTER_SITES= PYPI # no tests
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= pysndfile
|
||||
DISTVERSION= 1.4.4
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= audio python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= resampy
|
||||
DISTVERSION= 0.4.2
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= audio python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= simpleaudio
|
||||
DISTVERSION= 1.0.4
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
#MASTER_SITES= PYPI # no tests
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= sounddevice
|
||||
DISTVERSION= 0.4.6
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= audio python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= soxr
|
||||
DISTVERSION= 0.3.4
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= audio python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= wavio
|
||||
DISTVERSION= 0.0.7
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= audio python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= squash
|
||||
PORTVERSION= 1.0
|
||||
PORTREVISION= 20
|
||||
PORTREVISION= 21
|
||||
CATEGORIES= audio
|
||||
MASTER_SITES= SAVANNAH
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= himenobench
|
||||
PORTVERSION= 2015.07.09
|
||||
PORTREVISION= 9
|
||||
PORTREVISION= 10
|
||||
CATEGORIES= benchmarks
|
||||
MASTER_SITES= http://accc.riken.jp/wp-content/uploads/2015/07/
|
||||
DISTFILES= himenobmtxp_xl.zip himenobmtxp_l.zip \
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= hpl
|
||||
DISTVERSION= 2.3
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
CATEGORIES= benchmarks
|
||||
MASTER_SITES= NETLIB/benchmark/hpl
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= IMB
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 2021.3
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= benchmarks parallel
|
||||
MASTER_SITES= https://github.com/intel/mpi-benchmarks/archive/refs/tags/
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= ior
|
||||
DISTVERSION= 3.3.0-20230112
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= benchmarks
|
||||
|
||||
MAINTAINER= yuri@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= mdtest
|
||||
PORTVERSION= 1.9.3
|
||||
PORTREVISION= 13
|
||||
PORTREVISION= 14
|
||||
CATEGORIES= benchmarks
|
||||
MASTER_SITES= SF/${PORTNAME}/${PORTNAME}%20latest/${PORTNAME}-${PORTVERSION}
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= octave-forge-benchmark
|
||||
PORTVERSION= 1.1.1
|
||||
PORTREVISION= 28
|
||||
PORTREVISION= 29
|
||||
CATEGORIES= benchmarks math
|
||||
MASTER_SITES= SF/octave/Octave%20Forge%20Packages/Old%20Monolithic%20Releases/R2009-05-08
|
||||
DISTNAME= ${OCTAVE_PKGNAME}-${DISTVERSIONFULL}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= polygraph
|
||||
DISTVERSION= 4.13.0
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
CATEGORIES= benchmarks www
|
||||
MASTER_SITES= http://www.web-polygraph.org/downloads/srcs/
|
||||
EXTRACT_SUFX= -src.tgz
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= naarad
|
||||
PORTVERSION= 1.0.15
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
PORTREVISION= 5
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
CATEGORIES= benchmarks python
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= Zopkio
|
||||
PORTVERSION= 0.2.5
|
||||
PORTREVISION= 5
|
||||
PORTREVISION= 6
|
||||
CATEGORIES= benchmarks python
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= abyss
|
||||
DISTVERSION= 2.3.5
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
|
||||
MAINTAINER= yuri@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= atac-seq
|
||||
DISTVERSION= 0.1.2
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
MASTER_SITES= # empty
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= augustus
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 3.5.0
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= biology science
|
||||
PKGNAMESUFFIX= -gene-prediction
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= biosig
|
||||
DISTVERSION= 2.5.0
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
MASTER_SITES= SF/${PORTNAME}/BioSig%20for%20C_C%2B%2B/src/
|
||||
DISTNAME= ${PORTNAME}-${PORTVERSION}.src
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= biosoup
|
||||
DISTVERSION= 0.10.0-2
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
DISTVERSIONSUFFIX= -g62b942c
|
||||
CATEGORIES= biology devel
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= biostar-tools
|
||||
PORTVERSION= 1.10.1
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
|
||||
MAINTAINER= jwb@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= bolt-lmm
|
||||
DISTVERSION= 2.3.6
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
MASTER_SITES= https://data.broadinstitute.org/alkesgroup/BOLT-LMM/downloads/
|
||||
DISTNAME= BOLT-LMM_v${PORTVERSION}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= CheckM
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 1.2.0
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
|
||||
MAINTAINER= yuri@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= cufflinks
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 2.2.1-89
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
PORTREVISION= 5
|
||||
DISTVERSIONSUFFIX= -gdc3b0cb
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= dDocent
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 2.7.8
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= biology java perl5 python
|
||||
|
||||
MAINTAINER= jwb@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= fastp
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 0.23.2
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
|
||||
MAINTAINER= jwb@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= gcta
|
||||
DISTVERSION= 1.26.0
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
MASTER_SITES= https://cnsgenomics.com/software/gcta/pre_gcta/:main \
|
||||
https://gitlab.com/libeigen/eigen/-/archive/${EIGEN_VERSION}/:eigen
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= gemma
|
||||
DISTVERSION= 0.98.3
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
|
||||
MAINTAINER= jwb@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= GroopM
|
||||
DISTVERSION= 0.3.4
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= haplohseq
|
||||
DISTVERSION= 0.1.2
|
||||
PORTREVISION= 6
|
||||
PORTREVISION= 7
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
|
||||
MAINTAINER= jwb@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= hhsuite
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 3.3.0
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= biology science
|
||||
|
||||
MAINTAINER= yuri@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= iqtree
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 2.0.6
|
||||
PORTREVISION= 4
|
||||
PORTREVISION= 5
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
|
||||
MAINTAINER= jrm@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= kallisto
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 0.48.0
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
PORTREVISION= 3
|
||||
PORTEPOCH= 1
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= molden
|
||||
DISTVERSION= 7.1
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTEPOCH= 1
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
MASTER_SITES= https://ftp.science.ru.nl/Molden/
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= ncbi-vdb
|
||||
DISTVERSION= 2.11.0
|
||||
PORTREVISION= 5
|
||||
PORTREVISION= 6
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
|
||||
MAINTAINER= mzaki@niid.go.jp
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= peak-classifier
|
||||
DISTVERSION= 0.1.4-5
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
DISTVERSIONSUFFIX= -ga5bcfec
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= plink
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 1.90b6.17
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
|
||||
MAINTAINER= mzaki@e-mail.ne.jp
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,7 +1,7 @@
|
|||
PORTNAME= prodigy-lig
|
||||
DISTVERSIONPREFIX= v
|
||||
DISTVERSION= 1.0.1
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
PORTREVISION= 2
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
|
||||
MAINTAINER= yuri@FreeBSD.org
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= psi88
|
||||
PORTVERSION= 1.0
|
||||
PORTREVISION= 16
|
||||
PORTREVISION= 17
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
MASTER_SITES= http://www.ccl.net/cca/software/SOURCES/FORTRAN/psi88/
|
||||
DISTNAME= ${PORTNAME}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= PySCeS
|
||||
DISTVERSION= 1.0.3
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= biom-format
|
||||
PORTVERSION= 2.1.10
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= biopython
|
||||
DISTVERSION= 1.81
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
MASTER_SITES= http://www.biopython.org/DIST/
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= biosig
|
||||
DISTVERSION= 2.5.0
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology
|
||||
MASTER_SITES= SF/${PORTNAME}/BioSig%20for%20C_C%2B%2B/src/
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= bx-python
|
||||
DISTVERSION= 0.8.13
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= crossmap
|
||||
DISTVERSION= 0.5.4
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= deepTools
|
||||
DISTVERSION= 3.5.1
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= dna-features-viewer
|
||||
DISTVERSION= 3.1.2
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= ete3
|
||||
DISTVERSION= 3.1.2
|
||||
PORTREVISION= 6
|
||||
PORTREVISION= 7
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,5 +1,6 @@
|
|||
PORTNAME= goatools
|
||||
DISTVERSION= 1.1.6
|
||||
PORTREVISION= 1
|
||||
CATEGORIES= biology python
|
||||
MASTER_SITES= PYPI
|
||||
PKGNAMEPREFIX= ${PYTHON_PKGNAMEPREFIX}
|
||||
|
|
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